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簡要描述:探針法熒光定量PCR試劑盒是使用探針法進行qPCR實驗的 即用型優(yōu)化預混液。兼容所有的qPCR檢測儀器,多種模板。探針法熒光定量PCR試劑盒使用時僅需加入模板、探針和引物即可進行實驗。
產(chǎn)品型號:
所屬分類:PCR試劑盒
更新時間:2024-01-26
探針法熒光定量PCR試劑盒它具有下列特點:
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品RNA模板。
2. 引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,靈敏性高。
3. 提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據(jù)小反芻獸疫病毒高度保守區(qū)設(shè)計,不會跟其他病毒的RNA發(fā)生交叉反應(yīng)。
5. 本產(chǎn)品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 RT-PCR 反應(yīng)。
6. 本產(chǎn)品只能用于科研。
規(guī)格及成分
成分 |
編號 |
十孔盒包裝 |
探針法 qRT-PCR 緩沖液 |
A |
500μL(黃蓋) |
探針法 qRT-PCR 酶混合液 |
B |
100μL(紅蓋) |
熒光 PCR 模板稀釋液 |
C |
1 mL(黃蓋) |
探針法 qRT-PCR引物混合液 |
D |
100 μL(白蓋) |
小反芻獸疫病毒 qRT-PCR 探針 |
E |
50 μL(棕色管) |
探針法 qRT-PCR陽性對照(1×10E8 拷貝/μL) |
F |
50 μL(黃蓋) |
核酸釋釋劑(試用裝) |
G |
20 次(1mL,綠蓋) |
使用手冊 |
H |
一份 |
運輸及保存: 低溫運輸,-20℃保存,保存期限為12個月。
探針法熒光定量PCR試劑盒自備試劑 :樣品 RNA。
使用方法
一、稀釋標準曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)。由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區(qū)域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 段作為陽性對照。
1. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 RT-PCR 模板稀釋液,用帶芯槍頭,下同)。
3. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品 RNA 的制備
7. 如果有N個樣品,設(shè)置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?0μL陽性對照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。
8. 用自選方法純化樣品的RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。也以選購本公司的柱式病毒RNAout。本試劑盒免費贈送20次免RNA提取的核酸釋放劑試用裝,該釋放劑的裂解液可以直接作為RT-PCR模板,省略了RNA提取步驟。
三、Probe qRT-PCR 反應(yīng)(20μL 體系,在樣品制備室進行)
9. 如果做定量分析并且只做1次重復,則標記N+9個PCR 管,其中N+2個用于上步得到的 N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),6個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復,則標記N+4 個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),1個用于PCR陽性對照(用第4號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
10. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加):
成分 |
樣品管N+2個 |
RT-PCR陰性對照管 |
標準曲線樣品管
(2-7 管) |
探針法qPCR緩沖液 |
各 10 μL |
10 μL |
各 10 μL |
探針法 qPCR 酶混合液 |
各 2 μL |
2 μL |
各 2 μL |
qRT-PCR探針 |
各 1 μL |
1 μL |
各 1 μL |
探針qRT-PCR
引物混合液 |
各 2 μL |
2 μL |
各 2 μL |
待測樣品 RNA 模板 |
各 5 μL |
-- |
-- |
超純水 |
-- |
5 μL |
-- |
第 7 步所得標準曲線樣品稀釋液(2-7 號) |
-- |
-- |
各5 μL(2號樣到2號管,3號樣到3 號管…) |
過程 |
溫度 |
時間 |
逆轉(zhuǎn)錄 |
50℃ |
30 min |
預變性 |
94℃ |
10 min |
qRT-PCR 反應(yīng)(40 個循環(huán)) |
94℃ |
15 sec |
60℃ |
1 min(采集 FAM 通道的熒光信號) |
五、數(shù)據(jù)處理
12. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品RNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。
13. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴增曲線,Ct 值應(yīng)該小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復一次。重復實驗的 Ct值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 35,則為陽性。
六、常見問題與解決方法:
常見問題 |
可能原因 |
解決方法 |
陽性對照、待測樣本均無條帶。 |
PCR反應(yīng)體系或反應(yīng)條件不合適。 |
使用梯度PCR摸索PCR反應(yīng)條件。 |
PCR試劑保存不當失去活性。 |
2× PCR Mix應(yīng)保存于-20℃,使用時避免反復凍融。若使用頻繁,可在4℃短時間存放。 | |
引物設(shè)計問題。 |
嘗試重新設(shè)計引物進行檢查。 | |
陽性對照有目的條帶,待測樣本無條帶或條帶弱。 |
不當儲存或長期儲存引起試劑活性喪失。 |
使用新鮮的試劑。 |
加入組織裂解液過量。 |
增大反應(yīng)體系,或減少裂解液的用量。 | |
樣本裂解混合液保存不當或保存時間過久,DNA基因組已經(jīng)降解。 |
裂解混合液液可在4℃保存2-3天,盡量使用新制備的裂解液混合液進行PCR。 | |
模板加入量不適合。 |
在反應(yīng)體系10-20%范圍內(nèi)優(yōu)化模板加入量。反應(yīng)效性能較差時,可以降模板濃度調(diào)節(jié)到低于10%的范圍。 | |
PCR循環(huán)數(shù)不足。 |
適當增加PCR的循環(huán)數(shù),推薦在35-40循環(huán)為佳。因為模板復雜,一般PCR反應(yīng)要比用純化的 DNA模板多5-10個循環(huán)為佳。 | |
非特異性擴增 |
PCR退火溫度太低,循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度太高。 |
增加PCR退火溫度,降低PCR循環(huán)數(shù)、引物濃度或模板濃度。 |
PCR引物錯配。 |
重新設(shè)計PCR引物。 | |
配制PCR反應(yīng)體系時溫度太高或配制完成后放置時間太久。 |
PCR反應(yīng)體系的配制在低溫下進行,配制完成后盡快進行PCR擴增反應(yīng)。 | |
陰性對照出現(xiàn)目的條帶 |
操作工具或試劑污染。 |
實驗所有試劑或器材均應(yīng)高壓滅菌。操作時應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或濺出離心管外。 |
樣本間交叉污染。 |
每個取樣器只對一個樣本使用;或取完一個樣本后,將取樣器刃口浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復涮洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液。 |
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