探針?lè)晒舛縋CR試劑盒制備工藝流程主要包括核酸提取、反轉(zhuǎn)錄、探針設(shè)計(jì)合成、反應(yīng)體系配制以及熒光定量PCR檢測(cè)等步驟。具體流程如下:
1.核酸提取
樣本準(zhǔn)備:采集目標(biāo)樣本,如組織、血液或細(xì)胞。
RNA 提取:使用QIAGEN RNeasy Mini Kit或其他類(lèi)似試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行RNA提取,確保RNA的純度和完整性。
DNA 提?。喝粜鑿臉颖局刑崛NA,采用相應(yīng)的基因組DNA純化試劑盒進(jìn)行操作。
2.反轉(zhuǎn)錄
cDNA 合成:將提取的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,通常使用PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser,此試劑盒包含去除基因組DNA的gDNA Eraser和反轉(zhuǎn)錄酶。
DNase I處理:在反轉(zhuǎn)錄前對(duì)Total RNA樣品進(jìn)行DNase I處理,以除去殘存的基因組DNA,避免對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)造成干擾。
3.探針設(shè)計(jì)合成
探針設(shè)計(jì):根據(jù)目標(biāo)基因序列設(shè)計(jì)特異性探針,一般選擇與目標(biāo)序列匹配的寡核苷酸探針,并在5’端標(biāo)記熒光報(bào)告基團(tuán),3’端標(biāo)記淬滅基團(tuán)。
探針合成:利用自動(dòng)化核酸合成儀器進(jìn)行探針的化學(xué)合成,并純化得到的探針以確保其質(zhì)量。
混合試劑:將PCR酶、dNTPs、緩沖液、Mg??、引物、探針和模板cDNA按比例混合,形成完整的PCR反應(yīng)體系。
分裝反應(yīng)液:將混合好的反應(yīng)液分裝到PCR管或多孔板中,每個(gè)反應(yīng)單元體積一致,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。
5.熒光定量PCR檢測(cè)
PCR 擴(kuò)增:在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀器中進(jìn)行擴(kuò)增,通過(guò)設(shè)定特定的循環(huán)參數(shù)(變性、退火、延伸)來(lái)控制PCR過(guò)程。
熒光數(shù)據(jù)采集:儀器在每個(gè)循環(huán)后自動(dòng)采集熒光數(shù)據(jù),實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)的變化,并根據(jù)Ct值計(jì)算初始模板量。
數(shù)據(jù)分析輸出:軟件自動(dòng)生成擴(kuò)增曲線(xiàn)和熔解曲線(xiàn),并進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,輸出檢測(cè)結(jié)果。